Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vash1Q8C1W1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vash1Q8C1W1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vash1Q8C1W1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms