Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C1R3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms