Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms