Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vps13cQ8BX70 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps13cQ8BX70 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms