Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms