Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fbxo38Q8BMI0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fbxo38Q8BMI0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fbxo38Q8BMI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms