Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms