Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp1Q8BJQ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp1Q8BJQ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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