Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smndc1Q8BGT7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smndc1Q8BGT7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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