Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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