Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas4Q8BGD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas4Q8BGD7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms