Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms