Protein–RNA interactions for Protein: Q810U4

Nrcam, Neuronal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrcamQ810U4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrcamQ810U4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrcamQ810U4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms