Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms