Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zbed4Q80WQ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms