Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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