Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IfnkQ7TSL0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IfnkQ7TSL0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IfnkQ7TSL0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IfnkQ7TSL0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms