Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms