Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms