Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actn1Q7TPR4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms