Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms