Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp3Q7TNH6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms