Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmc8Q7TN58 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms