Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms