Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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