Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stambpl1Q76N33 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stambpl1Q76N33 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms