Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube2r2Q6ZWZ2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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