Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms