Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Topbp1Q6ZQF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms