Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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