Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms