Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms