Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cachd1Q6PDJ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cachd1Q6PDJ1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms