Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtminQ6P9S1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtminQ6P9S1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms