Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms