Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Soga3Q6NZL0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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Soga3Q6NZL0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Soga3Q6NZL0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms