Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SphkapQ6NSW3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms