Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms