Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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