Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn4Q69Z26 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms