Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top2bQ64511 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms