Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms