Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms