Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irf4Q64287 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irf4Q64287 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irf4Q64287 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irf4Q64287 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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