Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf1Q64213 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf1Q64213 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf1Q64213 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf1Q64213 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf1Q64213 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf1Q64213 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sf1Q64213 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf1Q64213 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms