Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim24Q64127 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim24Q64127 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim24Q64127 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms