Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms