Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Lcn4Q62472 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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