Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn3Q62471 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn3Q62471 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn3Q62471 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn3Q62471 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn3Q62471 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms