Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms